Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Znf518aB2RRF6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Znf518aB2RRF6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Znf518aB2RRF6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Znf518aB2RRF6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Znf518aB2RRF6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Znf518aB2RRF6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Znf518aB2RRF6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Znf518aB2RRF6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Znf518aB2RRF6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Znf518aB2RRF6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Znf518aB2RRF6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Znf518aB2RRF6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Znf518aB2RRF6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Znf518aB2RRF6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Znf518aB2RRF6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Znf518aB2RRF6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Znf518aB2RRF6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms