Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud4B2RRE7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms