Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zbed5B2RPU8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms