Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H60cB1B213 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H60cB1B213 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H60cB1B213 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H60cB1B213 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H60cB1B213 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H60cB1B213 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H60cB1B213 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H60cB1B213 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H60cB1B213 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H60cB1B213 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H60cB1B213 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms