Protein–RNA interactions for Protein: B1B212

H60b, Histocompatibility antigen 60b, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60bB1B212 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H60bB1B212 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H60bB1B212 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H60bB1B212 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H60bB1B212 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H60bB1B212 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H60bB1B212 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H60bB1B212 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H60bB1B212 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H60bB1B212 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms