Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spocd1B1ASB6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spocd1B1ASB6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms