Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm438B1ASB3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm438B1ASB3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms