Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik3B1AS29 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms