Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms