Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odf2A3KGV1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms