Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc9bA3KGF9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc9bA3KGF9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc9bA3KGF9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc9bA3KGF9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc9bA3KGF9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc9bA3KGF9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc9bA3KGF9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc9bA3KGF9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc9bA3KGF9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc9bA3KGF9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc9bA3KGF9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc9bA3KGF9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc9bA3KGF9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc9bA3KGF9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc9bA3KGF9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc9bA3KGF9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc9bA3KGF9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc9bA3KGF9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc9bA3KGF9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc9bA3KGF9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms