Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samt1A2BED8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms