Protein–RNA interactions for Protein: A2AX52

Col6a4, Collagen alpha-4(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a4A2AX52 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms