Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Upf2A2AT37 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms