Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scn3aA2ASI5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn3aA2ASI5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms