Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syndig1A2ANU3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms