Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prdm12A2AJ77 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm12A2AJ77 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms