Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin3aA2AIR5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin3aA2AIR5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin3aA2AIR5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin3aA2AIR5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin3aA2AIR5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin3aA2AIR5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin3aA2AIR5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin3aA2AIR5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin3aA2AIR5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin3aA2AIR5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin3aA2AIR5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin3aA2AIR5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin3aA2AIR5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin3aA2AIR5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin3aA2AIR5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin3aA2AIR5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3aA2AIR5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3aA2AIR5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3aA2AIR5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3aA2AIR5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3aA2AIR5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3aA2AIR5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3aA2AIR5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3aA2AIR5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3aA2AIR5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3aA2AIR5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3aA2AIR5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3aA2AIR5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3aA2AIR5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3aA2AIR5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3aA2AIR5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3aA2AIR5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3aA2AIR5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3aA2AIR5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3aA2AIR5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3aA2AIR5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3aA2AIR5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3aA2AIR5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms