Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms