Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms