Protein–RNA interactions for Protein: A2A447

Rhox2b, Reproductive homeobox 2B, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2bA2A447 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox2bA2A447 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox2bA2A447 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms