Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms