Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H9

Igkv1-132, Immunoglobulin kappa variable 1-132 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms