Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trbv23A0A0A6YWQ1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms