Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ift43Q9DA69 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ift43Q9DA69 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift43Q9DA69 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift43Q9DA69 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ift43Q9DA69 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ift43Q9DA69 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ift43Q9DA69 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ift43Q9DA69 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift43Q9DA69 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift43Q9DA69 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ift43Q9DA69 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ift43Q9DA69 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ift43Q9DA69 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ift43Q9DA69 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ift43Q9DA69 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ift43Q9DA69 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ift43Q9DA69 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ift43Q9DA69 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ift43Q9DA69 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ift43Q9DA69 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ift43Q9DA69 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ift43Q9DA69 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ift43Q9DA69 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ift43Q9DA69 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ift43Q9DA69 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ift43Q9DA69 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ift43Q9DA69 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ift43Q9DA69 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ift43Q9DA69 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ift43Q9DA69 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ift43Q9DA69 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ift43Q9DA69 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ift43Q9DA69 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ift43Q9DA69 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ift43Q9DA69 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ift43Q9DA69 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ift43Q9DA69 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ift43Q9DA69 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ift43Q9DA69 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ift43Q9DA69 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ift43Q9DA69 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ift43Q9DA69 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ift43Q9DA69 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ift43Q9DA69 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ift43Q9DA69 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ift43Q9DA69 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ift43Q9DA69 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ift43Q9DA69 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ift43Q9DA69 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ift43Q9DA69 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ift43Q9DA69 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ift43Q9DA69 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ift43Q9DA69 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ift43Q9DA69 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ift43Q9DA69 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ift43Q9DA69 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ift43Q9DA69 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ift43Q9DA69 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift43Q9DA69 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift43Q9DA69 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift43Q9DA69 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift43Q9DA69 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ift43Q9DA69 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ift43Q9DA69 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ift43Q9DA69 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ift43Q9DA69 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ift43Q9DA69 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ift43Q9DA69 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ift43Q9DA69 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ift43Q9DA69 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ift43Q9DA69 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ift43Q9DA69 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ift43Q9DA69 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ift43Q9DA69 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ift43Q9DA69 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ift43Q9DA69 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ift43Q9DA69 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ift43Q9DA69 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ift43Q9DA69 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ift43Q9DA69 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ift43Q9DA69 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ift43Q9DA69 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ift43Q9DA69 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ift43Q9DA69 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ift43Q9DA69 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ift43Q9DA69 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ift43Q9DA69 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ift43Q9DA69 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ift43Q9DA69 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift43Q9DA69 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ift43Q9DA69 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ift43Q9DA69 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ift43Q9DA69 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ift43Q9DA69 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ift43Q9DA69 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ift43Q9DA69 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift43Q9DA69 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift43Q9DA69 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift43Q9DA69 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms