Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D8N1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D8N1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Q9D8N1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D8N1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D8N1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D8N1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D8N1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D8N1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D8N1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D8N1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D8N1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D8N1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D8N1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9D8N1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D8N1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D8N1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D8N1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9D8N1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9D8N1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9D8N1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9D8N1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D8N1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D8N1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D8N1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D8N1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D8N1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D8N1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D8N1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D8N1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D8N1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9D8N1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q9D8N1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D8N1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D8N1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D8N1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D8N1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D8N1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D8N1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D8N1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D8N1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D8N1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D8N1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D8N1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D8N1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D8N1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D8N1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D8N1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D8N1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D8N1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9D8N1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9D8N1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9D8N1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D8N1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D8N1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D8N1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D8N1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9D8N1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9D8N1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9D8N1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9D8N1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D8N1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D8N1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D8N1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9D8N1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D8N1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D8N1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D8N1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D8N1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D8N1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D8N1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D8N1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D8N1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D8N1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D8N1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9D8N1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D8N1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D8N1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D8N1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D8N1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D8N1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D8N1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D8N1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D8N1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D8N1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D8N1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D8N1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D8N1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D8N1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D8N1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D8N1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D8N1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D8N1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D8N1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D8N1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D8N1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9D8N1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9D8N1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9D8N1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9D8N1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms