Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC7

Nipal2, NIPA-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipal2Q91WC7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nipal2Q91WC7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nipal2Q91WC7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nipal2Q91WC7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nipal2Q91WC7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nipal2Q91WC7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nipal2Q91WC7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nipal2Q91WC7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nipal2Q91WC7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nipal2Q91WC7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nipal2Q91WC7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nipal2Q91WC7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nipal2Q91WC7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nipal2Q91WC7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nipal2Q91WC7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nipal2Q91WC7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nipal2Q91WC7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nipal2Q91WC7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nipal2Q91WC7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nipal2Q91WC7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nipal2Q91WC7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nipal2Q91WC7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nipal2Q91WC7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nipal2Q91WC7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nipal2Q91WC7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nipal2Q91WC7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nipal2Q91WC7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nipal2Q91WC7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nipal2Q91WC7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nipal2Q91WC7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nipal2Q91WC7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nipal2Q91WC7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nipal2Q91WC7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nipal2Q91WC7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nipal2Q91WC7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nipal2Q91WC7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nipal2Q91WC7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nipal2Q91WC7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nipal2Q91WC7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nipal2Q91WC7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nipal2Q91WC7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nipal2Q91WC7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nipal2Q91WC7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nipal2Q91WC7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nipal2Q91WC7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nipal2Q91WC7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nipal2Q91WC7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nipal2Q91WC7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nipal2Q91WC7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nipal2Q91WC7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nipal2Q91WC7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nipal2Q91WC7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nipal2Q91WC7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nipal2Q91WC7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nipal2Q91WC7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nipal2Q91WC7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nipal2Q91WC7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nipal2Q91WC7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nipal2Q91WC7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nipal2Q91WC7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nipal2Q91WC7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nipal2Q91WC7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nipal2Q91WC7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nipal2Q91WC7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nipal2Q91WC7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nipal2Q91WC7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nipal2Q91WC7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nipal2Q91WC7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nipal2Q91WC7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nipal2Q91WC7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nipal2Q91WC7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nipal2Q91WC7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nipal2Q91WC7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nipal2Q91WC7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nipal2Q91WC7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nipal2Q91WC7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nipal2Q91WC7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nipal2Q91WC7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nipal2Q91WC7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nipal2Q91WC7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nipal2Q91WC7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nipal2Q91WC7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nipal2Q91WC7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nipal2Q91WC7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nipal2Q91WC7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nipal2Q91WC7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nipal2Q91WC7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nipal2Q91WC7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nipal2Q91WC7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nipal2Q91WC7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nipal2Q91WC7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nipal2Q91WC7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nipal2Q91WC7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nipal2Q91WC7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nipal2Q91WC7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nipal2Q91WC7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nipal2Q91WC7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nipal2Q91WC7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nipal2Q91WC7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nipal2Q91WC7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms