Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Dnaaf4Q8R368 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Dnaaf4Q8R368 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Dnaaf4Q8R368 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Dnaaf4Q8R368 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Dnaaf4Q8R368 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Dnaaf4Q8R368 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Dnaaf4Q8R368 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Dnaaf4Q8R368 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Dnaaf4Q8R368 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Dnaaf4Q8R368 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Dnaaf4Q8R368 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Dnaaf4Q8R368 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Dnaaf4Q8R368 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Dnaaf4Q8R368 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Dnaaf4Q8R368 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Dnaaf4Q8R368 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Dnaaf4Q8R368 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Dnaaf4Q8R368 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Dnaaf4Q8R368 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Dnaaf4Q8R368 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Dnaaf4Q8R368 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Dnaaf4Q8R368 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Dnaaf4Q8R368 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Dnaaf4Q8R368 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Dnaaf4Q8R368 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Dnaaf4Q8R368 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Dnaaf4Q8R368 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Dnaaf4Q8R368 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Dnaaf4Q8R368 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Dnaaf4Q8R368 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Dnaaf4Q8R368 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Dnaaf4Q8R368 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Dnaaf4Q8R368 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Dnaaf4Q8R368 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Dnaaf4Q8R368 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Dnaaf4Q8R368 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Dnaaf4Q8R368 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Dnaaf4Q8R368 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Dnaaf4Q8R368 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Dnaaf4Q8R368 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Dnaaf4Q8R368 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Dnaaf4Q8R368 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Dnaaf4Q8R368 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Dnaaf4Q8R368 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Dnaaf4Q8R368 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Dnaaf4Q8R368 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Dnaaf4Q8R368 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Dnaaf4Q8R368 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Dnaaf4Q8R368 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Dnaaf4Q8R368 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Dnaaf4Q8R368 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Dnaaf4Q8R368 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Dnaaf4Q8R368 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Dnaaf4Q8R368 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Dnaaf4Q8R368 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Dnaaf4Q8R368 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Dnaaf4Q8R368 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Dnaaf4Q8R368 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Dnaaf4Q8R368 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Dnaaf4Q8R368 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Dnaaf4Q8R368 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Dnaaf4Q8R368 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Dnaaf4Q8R368 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Dnaaf4Q8R368 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Dnaaf4Q8R368 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Dnaaf4Q8R368 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Dnaaf4Q8R368 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Dnaaf4Q8R368 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Dnaaf4Q8R368 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Dnaaf4Q8R368 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Dnaaf4Q8R368 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Dnaaf4Q8R368 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Dnaaf4Q8R368 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Dnaaf4Q8R368 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Dnaaf4Q8R368 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Dnaaf4Q8R368 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Dnaaf4Q8R368 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Dnaaf4Q8R368 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Dnaaf4Q8R368 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Dnaaf4Q8R368 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Dnaaf4Q8R368 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Dnaaf4Q8R368 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Dnaaf4Q8R368 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Dnaaf4Q8R368 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Dnaaf4Q8R368 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Dnaaf4Q8R368 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Dnaaf4Q8R368 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Dnaaf4Q8R368 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Dnaaf4Q8R368 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Dnaaf4Q8R368 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Dnaaf4Q8R368 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Dnaaf4Q8R368 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Dnaaf4Q8R368 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Dnaaf4Q8R368 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Dnaaf4Q8R368 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Dnaaf4Q8R368 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Dnaaf4Q8R368 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Dnaaf4Q8R368 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Dnaaf4Q8R368 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms