Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU1

Cfap20, Cilia- and flagella-associated protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap20Q8BTU1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cfap20Q8BTU1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cfap20Q8BTU1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cfap20Q8BTU1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cfap20Q8BTU1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cfap20Q8BTU1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfap20Q8BTU1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfap20Q8BTU1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap20Q8BTU1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap20Q8BTU1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap20Q8BTU1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap20Q8BTU1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap20Q8BTU1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfap20Q8BTU1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfap20Q8BTU1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap20Q8BTU1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap20Q8BTU1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap20Q8BTU1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cfap20Q8BTU1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfap20Q8BTU1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfap20Q8BTU1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cfap20Q8BTU1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cfap20Q8BTU1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cfap20Q8BTU1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cfap20Q8BTU1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cfap20Q8BTU1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cfap20Q8BTU1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cfap20Q8BTU1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap20Q8BTU1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap20Q8BTU1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap20Q8BTU1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap20Q8BTU1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap20Q8BTU1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap20Q8BTU1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfap20Q8BTU1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfap20Q8BTU1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap20Q8BTU1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap20Q8BTU1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap20Q8BTU1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap20Q8BTU1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap20Q8BTU1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap20Q8BTU1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap20Q8BTU1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap20Q8BTU1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap20Q8BTU1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap20Q8BTU1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap20Q8BTU1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfap20Q8BTU1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfap20Q8BTU1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap20Q8BTU1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap20Q8BTU1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfap20Q8BTU1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfap20Q8BTU1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap20Q8BTU1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap20Q8BTU1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap20Q8BTU1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap20Q8BTU1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap20Q8BTU1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap20Q8BTU1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap20Q8BTU1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap20Q8BTU1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap20Q8BTU1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap20Q8BTU1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap20Q8BTU1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap20Q8BTU1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap20Q8BTU1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap20Q8BTU1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap20Q8BTU1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap20Q8BTU1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap20Q8BTU1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap20Q8BTU1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap20Q8BTU1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap20Q8BTU1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap20Q8BTU1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap20Q8BTU1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap20Q8BTU1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap20Q8BTU1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap20Q8BTU1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap20Q8BTU1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap20Q8BTU1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap20Q8BTU1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap20Q8BTU1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap20Q8BTU1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap20Q8BTU1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap20Q8BTU1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap20Q8BTU1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap20Q8BTU1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap20Q8BTU1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap20Q8BTU1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap20Q8BTU1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap20Q8BTU1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap20Q8BTU1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap20Q8BTU1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap20Q8BTU1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap20Q8BTU1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap20Q8BTU1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap20Q8BTU1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap20Q8BTU1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap20Q8BTU1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap20Q8BTU1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms