Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWT3

Slc25a35, Solute carrier family 25 member 35, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a35Q5SWT3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc25a35Q5SWT3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc25a35Q5SWT3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc25a35Q5SWT3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc25a35Q5SWT3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc25a35Q5SWT3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc25a35Q5SWT3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc25a35Q5SWT3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc25a35Q5SWT3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc25a35Q5SWT3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc25a35Q5SWT3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc25a35Q5SWT3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc25a35Q5SWT3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc25a35Q5SWT3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc25a35Q5SWT3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc25a35Q5SWT3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc25a35Q5SWT3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc25a35Q5SWT3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc25a35Q5SWT3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc25a35Q5SWT3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc25a35Q5SWT3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc25a35Q5SWT3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc25a35Q5SWT3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc25a35Q5SWT3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc25a35Q5SWT3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc25a35Q5SWT3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc25a35Q5SWT3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc25a35Q5SWT3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc25a35Q5SWT3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc25a35Q5SWT3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc25a35Q5SWT3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc25a35Q5SWT3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc25a35Q5SWT3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc25a35Q5SWT3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc25a35Q5SWT3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc25a35Q5SWT3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc25a35Q5SWT3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc25a35Q5SWT3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc25a35Q5SWT3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc25a35Q5SWT3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc25a35Q5SWT3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc25a35Q5SWT3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc25a35Q5SWT3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc25a35Q5SWT3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc25a35Q5SWT3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc25a35Q5SWT3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc25a35Q5SWT3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc25a35Q5SWT3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc25a35Q5SWT3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc25a35Q5SWT3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc25a35Q5SWT3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc25a35Q5SWT3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc25a35Q5SWT3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc25a35Q5SWT3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc25a35Q5SWT3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc25a35Q5SWT3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc25a35Q5SWT3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc25a35Q5SWT3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc25a35Q5SWT3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc25a35Q5SWT3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc25a35Q5SWT3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc25a35Q5SWT3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc25a35Q5SWT3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc25a35Q5SWT3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc25a35Q5SWT3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc25a35Q5SWT3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc25a35Q5SWT3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc25a35Q5SWT3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc25a35Q5SWT3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc25a35Q5SWT3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc25a35Q5SWT3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc25a35Q5SWT3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc25a35Q5SWT3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc25a35Q5SWT3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc25a35Q5SWT3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc25a35Q5SWT3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc25a35Q5SWT3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc25a35Q5SWT3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc25a35Q5SWT3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc25a35Q5SWT3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc25a35Q5SWT3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc25a35Q5SWT3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc25a35Q5SWT3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc25a35Q5SWT3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc25a35Q5SWT3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc25a35Q5SWT3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc25a35Q5SWT3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc25a35Q5SWT3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc25a35Q5SWT3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc25a35Q5SWT3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc25a35Q5SWT3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc25a35Q5SWT3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc25a35Q5SWT3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc25a35Q5SWT3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc25a35Q5SWT3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc25a35Q5SWT3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc25a35Q5SWT3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc25a35Q5SWT3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc25a35Q5SWT3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc25a35Q5SWT3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms