Protein–RNA interactions for Protein: Q3UME2

Tmem241, Transmembrane protein 241, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem241Q3UME2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem241Q3UME2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem241Q3UME2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem241Q3UME2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem241Q3UME2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem241Q3UME2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem241Q3UME2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem241Q3UME2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem241Q3UME2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem241Q3UME2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem241Q3UME2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem241Q3UME2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem241Q3UME2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem241Q3UME2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem241Q3UME2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem241Q3UME2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem241Q3UME2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem241Q3UME2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem241Q3UME2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem241Q3UME2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem241Q3UME2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem241Q3UME2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem241Q3UME2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem241Q3UME2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem241Q3UME2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem241Q3UME2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem241Q3UME2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem241Q3UME2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem241Q3UME2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem241Q3UME2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem241Q3UME2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem241Q3UME2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem241Q3UME2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem241Q3UME2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem241Q3UME2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem241Q3UME2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem241Q3UME2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem241Q3UME2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem241Q3UME2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem241Q3UME2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem241Q3UME2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem241Q3UME2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem241Q3UME2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem241Q3UME2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem241Q3UME2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem241Q3UME2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem241Q3UME2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem241Q3UME2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem241Q3UME2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem241Q3UME2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem241Q3UME2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem241Q3UME2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem241Q3UME2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem241Q3UME2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem241Q3UME2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem241Q3UME2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem241Q3UME2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem241Q3UME2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem241Q3UME2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem241Q3UME2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem241Q3UME2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem241Q3UME2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem241Q3UME2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem241Q3UME2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem241Q3UME2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem241Q3UME2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem241Q3UME2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem241Q3UME2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem241Q3UME2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem241Q3UME2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem241Q3UME2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem241Q3UME2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem241Q3UME2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem241Q3UME2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem241Q3UME2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem241Q3UME2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem241Q3UME2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem241Q3UME2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem241Q3UME2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem241Q3UME2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem241Q3UME2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem241Q3UME2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem241Q3UME2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem241Q3UME2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem241Q3UME2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem241Q3UME2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem241Q3UME2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem241Q3UME2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem241Q3UME2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem241Q3UME2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem241Q3UME2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem241Q3UME2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem241Q3UME2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem241Q3UME2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem241Q3UME2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem241Q3UME2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem241Q3UME2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem241Q3UME2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem241Q3UME2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem241Q3UME2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms