Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,79■■□□□ 1,08
CtdsplP58465 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
CtdsplP58465 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
CtdsplP58465 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
CtdsplP58465 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
CtdsplP58465 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,78■■□□□ 1,08
CtdsplP58465 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
CtdsplP58465 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
CtdsplP58465 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21,76■■□□□ 1,07
CtdsplP58465 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
CtdsplP58465 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
CtdsplP58465 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
CtdsplP58465 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
CtdsplP58465 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
CtdsplP58465 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21,72■■□□□ 1,07
CtdsplP58465 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
CtdsplP58465 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
CtdsplP58465 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
CtdsplP58465 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
CtdsplP58465 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
CtdsplP58465 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
CtdsplP58465 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,7■■□□□ 1,06
CtdsplP58465 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21,7■■□□□ 1,06
CtdsplP58465 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
CtdsplP58465 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
CtdsplP58465 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21,68■■□□□ 1,06
CtdsplP58465 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
CtdsplP58465 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,67■■□□□ 1,06
CtdsplP58465 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,66■■□□□ 1,06
CtdsplP58465 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
CtdsplP58465 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
CtdsplP58465 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21,66■■□□□ 1,06
CtdsplP58465 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
CtdsplP58465 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
CtdsplP58465 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
CtdsplP58465 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21,62■■□□□ 1,05
CtdsplP58465 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
CtdsplP58465 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
CtdsplP58465 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
CtdsplP58465 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
CtdsplP58465 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
CtdsplP58465 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
CtdsplP58465 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
CtdsplP58465 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
CtdsplP58465 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
CtdsplP58465 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
CtdsplP58465 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
CtdsplP58465 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21,58■■□□□ 1,05
CtdsplP58465 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
CtdsplP58465 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21,57■■□□□ 1,04
CtdsplP58465 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
CtdsplP58465 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
CtdsplP58465 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
CtdsplP58465 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
CtdsplP58465 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
CtdsplP58465 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21,55■■□□□ 1,04
CtdsplP58465 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21,53■■□□□ 1,04
CtdsplP58465 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
CtdsplP58465 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
CtdsplP58465 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
CtdsplP58465 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21,52■■□□□ 1,04
CtdsplP58465 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21,52■■□□□ 1,04
CtdsplP58465 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,52■■□□□ 1,04
CtdsplP58465 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
CtdsplP58465 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
CtdsplP58465 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
CtdsplP58465 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
CtdsplP58465 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
CtdsplP58465 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
CtdsplP58465 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
CtdsplP58465 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
CtdsplP58465 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21,46■■□□□ 1,03
CtdsplP58465 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
CtdsplP58465 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
CtdsplP58465 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
CtdsplP58465 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
CtdsplP58465 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
CtdsplP58465 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
CtdsplP58465 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
CtdsplP58465 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,42■■□□□ 1,02
CtdsplP58465 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
CtdsplP58465 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
CtdsplP58465 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
CtdsplP58465 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
CtdsplP58465 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
CtdsplP58465 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,39■■□□□ 1,01
CtdsplP58465 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
CtdsplP58465 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21,38■■□□□ 1,01
CtdsplP58465 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
CtdsplP58465 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
CtdsplP58465 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21,35■■□□□ 1,01
CtdsplP58465 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
CtdsplP58465 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
CtdsplP58465 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
CtdsplP58465 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21,34■■□□□ 1,01
CtdsplP58465 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
CtdsplP58465 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
CtdsplP58465 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
CtdsplP58465 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
CtdsplP58465 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21,33■■□□□ 1,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms