Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Irf5P56477 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Irf5P56477 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Irf5P56477 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Irf5P56477 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Irf5P56477 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Irf5P56477 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Irf5P56477 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Irf5P56477 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Irf5P56477 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Irf5P56477 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Irf5P56477 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Irf5P56477 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Irf5P56477 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Irf5P56477 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Irf5P56477 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Irf5P56477 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Irf5P56477 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Irf5P56477 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Irf5P56477 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Irf5P56477 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Irf5P56477 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Irf5P56477 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Irf5P56477 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Irf5P56477 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Irf5P56477 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Irf5P56477 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Irf5P56477 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Irf5P56477 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Irf5P56477 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Irf5P56477 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Irf5P56477 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Irf5P56477 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Irf5P56477 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Irf5P56477 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Irf5P56477 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Irf5P56477 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Irf5P56477 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Irf5P56477 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Irf5P56477 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Irf5P56477 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Irf5P56477 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Irf5P56477 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Irf5P56477 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Irf5P56477 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Irf5P56477 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Irf5P56477 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Irf5P56477 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Irf5P56477 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Irf5P56477 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Irf5P56477 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Irf5P56477 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Irf5P56477 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Irf5P56477 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Irf5P56477 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Irf5P56477 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Irf5P56477 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Irf5P56477 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Irf5P56477 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Irf5P56477 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Irf5P56477 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Irf5P56477 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Irf5P56477 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Irf5P56477 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Irf5P56477 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Irf5P56477 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Irf5P56477 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Irf5P56477 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Irf5P56477 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Irf5P56477 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Irf5P56477 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Irf5P56477 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Irf5P56477 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Irf5P56477 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Irf5P56477 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Irf5P56477 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Irf5P56477 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Irf5P56477 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Irf5P56477 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Irf5P56477 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Irf5P56477 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Irf5P56477 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Irf5P56477 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Irf5P56477 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Irf5P56477 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Irf5P56477 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Irf5P56477 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Irf5P56477 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Irf5P56477 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Irf5P56477 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Irf5P56477 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Irf5P56477 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Irf5P56477 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Irf5P56477 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Irf5P56477 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Irf5P56477 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Irf5P56477 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Irf5P56477 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Irf5P56477 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Irf5P56477 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms