Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Brca1P48754 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Brca1P48754 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Brca1P48754 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Brca1P48754 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Brca1P48754 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Brca1P48754 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Brca1P48754 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Brca1P48754 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Brca1P48754 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Brca1P48754 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Brca1P48754 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Brca1P48754 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Brca1P48754 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Brca1P48754 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Brca1P48754 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Brca1P48754 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Brca1P48754 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Brca1P48754 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Brca1P48754 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Brca1P48754 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Brca1P48754 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Brca1P48754 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Brca1P48754 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Brca1P48754 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Brca1P48754 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Brca1P48754 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Brca1P48754 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Brca1P48754 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Brca1P48754 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Brca1P48754 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Brca1P48754 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Brca1P48754 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Brca1P48754 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Brca1P48754 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Brca1P48754 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Brca1P48754 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Brca1P48754 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Brca1P48754 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Brca1P48754 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Brca1P48754 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Brca1P48754 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Brca1P48754 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Brca1P48754 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Brca1P48754 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Brca1P48754 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Brca1P48754 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Brca1P48754 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Brca1P48754 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Brca1P48754 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Brca1P48754 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Brca1P48754 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Brca1P48754 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Brca1P48754 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Brca1P48754 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Brca1P48754 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Brca1P48754 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Brca1P48754 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Brca1P48754 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Brca1P48754 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Brca1P48754 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Brca1P48754 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Brca1P48754 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Brca1P48754 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Brca1P48754 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Brca1P48754 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Brca1P48754 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Brca1P48754 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Brca1P48754 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Brca1P48754 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Brca1P48754 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Brca1P48754 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Brca1P48754 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Brca1P48754 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Brca1P48754 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Brca1P48754 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Brca1P48754 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Brca1P48754 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Brca1P48754 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Brca1P48754 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Brca1P48754 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Brca1P48754 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Brca1P48754 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Brca1P48754 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Brca1P48754 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Brca1P48754 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Brca1P48754 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Brca1P48754 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Brca1P48754 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Brca1P48754 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Brca1P48754 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Brca1P48754 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Brca1P48754 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Brca1P48754 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Brca1P48754 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Brca1P48754 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Brca1P48754 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Brca1P48754 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Brca1P48754 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Brca1P48754 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms