Protein–RNA interactions for Protein: O88848

Arl6, ADP-ribosylation factor-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6O88848 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arl6O88848 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arl6O88848 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arl6O88848 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arl6O88848 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arl6O88848 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arl6O88848 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arl6O88848 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arl6O88848 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arl6O88848 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arl6O88848 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arl6O88848 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arl6O88848 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arl6O88848 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arl6O88848 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arl6O88848 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arl6O88848 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arl6O88848 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arl6O88848 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arl6O88848 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arl6O88848 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arl6O88848 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arl6O88848 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arl6O88848 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arl6O88848 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arl6O88848 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arl6O88848 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arl6O88848 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Arl6O88848 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arl6O88848 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arl6O88848 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arl6O88848 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arl6O88848 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arl6O88848 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arl6O88848 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arl6O88848 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arl6O88848 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arl6O88848 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arl6O88848 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arl6O88848 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arl6O88848 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arl6O88848 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arl6O88848 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arl6O88848 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arl6O88848 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arl6O88848 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arl6O88848 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arl6O88848 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Arl6O88848 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arl6O88848 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arl6O88848 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arl6O88848 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arl6O88848 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arl6O88848 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arl6O88848 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arl6O88848 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arl6O88848 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arl6O88848 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arl6O88848 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Arl6O88848 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arl6O88848 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Arl6O88848 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arl6O88848 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arl6O88848 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arl6O88848 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arl6O88848 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arl6O88848 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arl6O88848 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arl6O88848 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arl6O88848 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arl6O88848 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arl6O88848 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arl6O88848 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arl6O88848 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arl6O88848 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arl6O88848 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arl6O88848 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arl6O88848 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arl6O88848 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arl6O88848 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arl6O88848 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arl6O88848 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arl6O88848 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arl6O88848 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arl6O88848 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arl6O88848 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arl6O88848 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arl6O88848 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl6O88848 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl6O88848 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl6O88848 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arl6O88848 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arl6O88848 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arl6O88848 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arl6O88848 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arl6O88848 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arl6O88848 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arl6O88848 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arl6O88848 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arl6O88848 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1043.1 ms