Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ClppO88696 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ClppO88696 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ClppO88696 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ClppO88696 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ClppO88696 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ClppO88696 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ClppO88696 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ClppO88696 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ClppO88696 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ClppO88696 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ClppO88696 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ClppO88696 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ClppO88696 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ClppO88696 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ClppO88696 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ClppO88696 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ClppO88696 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ClppO88696 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClppO88696 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClppO88696 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ClppO88696 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ClppO88696 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ClppO88696 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ClppO88696 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ClppO88696 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClppO88696 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClppO88696 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClppO88696 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClppO88696 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClppO88696 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClppO88696 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ClppO88696 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClppO88696 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClppO88696 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClppO88696 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClppO88696 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClppO88696 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ClppO88696 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClppO88696 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClppO88696 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClppO88696 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClppO88696 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClppO88696 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClppO88696 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClppO88696 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClppO88696 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClppO88696 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClppO88696 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClppO88696 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClppO88696 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClppO88696 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClppO88696 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClppO88696 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClppO88696 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClppO88696 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ClppO88696 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClppO88696 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClppO88696 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClppO88696 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClppO88696 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClppO88696 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClppO88696 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClppO88696 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClppO88696 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClppO88696 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClppO88696 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClppO88696 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClppO88696 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClppO88696 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClppO88696 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClppO88696 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ClppO88696 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ClppO88696 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClppO88696 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClppO88696 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClppO88696 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClppO88696 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClppO88696 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClppO88696 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClppO88696 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClppO88696 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClppO88696 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClppO88696 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ClppO88696 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ClppO88696 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ClppO88696 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ClppO88696 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ClppO88696 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ClppO88696 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ClppO88696 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ClppO88696 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClppO88696 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClppO88696 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClppO88696 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClppO88696 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClppO88696 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClppO88696 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClppO88696 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClppO88696 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms