Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd46O88174 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd46O88174 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd46O88174 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd46O88174 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd46O88174 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd46O88174 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd46O88174 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd46O88174 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd46O88174 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd46O88174 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd46O88174 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd46O88174 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd46O88174 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd46O88174 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd46O88174 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd46O88174 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd46O88174 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd46O88174 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd46O88174 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd46O88174 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd46O88174 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd46O88174 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd46O88174 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd46O88174 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd46O88174 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd46O88174 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd46O88174 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd46O88174 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd46O88174 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd46O88174 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd46O88174 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd46O88174 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd46O88174 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd46O88174 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd46O88174 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd46O88174 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd46O88174 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd46O88174 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd46O88174 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd46O88174 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cd46O88174 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd46O88174 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd46O88174 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd46O88174 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd46O88174 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd46O88174 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd46O88174 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd46O88174 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd46O88174 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd46O88174 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd46O88174 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd46O88174 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd46O88174 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd46O88174 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd46O88174 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd46O88174 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd46O88174 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd46O88174 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd46O88174 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd46O88174 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cd46O88174 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd46O88174 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd46O88174 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd46O88174 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd46O88174 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd46O88174 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd46O88174 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd46O88174 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd46O88174 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd46O88174 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd46O88174 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd46O88174 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd46O88174 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd46O88174 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd46O88174 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd46O88174 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd46O88174 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd46O88174 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd46O88174 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd46O88174 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd46O88174 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd46O88174 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd46O88174 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd46O88174 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd46O88174 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd46O88174 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd46O88174 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd46O88174 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd46O88174 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd46O88174 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd46O88174 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd46O88174 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd46O88174 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd46O88174 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd46O88174 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd46O88174 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd46O88174 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd46O88174 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd46O88174 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms