Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrxO54751 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrxO54751 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrxO54751 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrxO54751 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CrxO54751 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CrxO54751 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CrxO54751 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CrxO54751 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CrxO54751 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CrxO54751 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CrxO54751 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CrxO54751 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CrxO54751 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CrxO54751 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CrxO54751 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CrxO54751 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CrxO54751 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CrxO54751 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CrxO54751 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CrxO54751 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CrxO54751 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CrxO54751 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CrxO54751 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CrxO54751 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrxO54751 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CrxO54751 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrxO54751 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrxO54751 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrxO54751 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrxO54751 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrxO54751 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrxO54751 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrxO54751 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrxO54751 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrxO54751 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrxO54751 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrxO54751 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrxO54751 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrxO54751 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrxO54751 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrxO54751 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrxO54751 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrxO54751 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrxO54751 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrxO54751 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrxO54751 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrxO54751 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrxO54751 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrxO54751 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CrxO54751 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrxO54751 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrxO54751 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrxO54751 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrxO54751 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrxO54751 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrxO54751 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CrxO54751 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrxO54751 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrxO54751 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrxO54751 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrxO54751 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrxO54751 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrxO54751 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrxO54751 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrxO54751 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrxO54751 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrxO54751 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrxO54751 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrxO54751 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrxO54751 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrxO54751 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrxO54751 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CrxO54751 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrxO54751 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrxO54751 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrxO54751 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrxO54751 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrxO54751 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrxO54751 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrxO54751 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrxO54751 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrxO54751 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrxO54751 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrxO54751 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrxO54751 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrxO54751 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrxO54751 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrxO54751 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrxO54751 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrxO54751 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrxO54751 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrxO54751 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrxO54751 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrxO54751 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrxO54751 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrxO54751 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrxO54751 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrxO54751 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CrxO54751 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms