Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Arid4aF8VPQ2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Arid4aF8VPQ2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Arid4aF8VPQ2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Arid4aF8VPQ2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Arid4aF8VPQ2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Arid4aF8VPQ2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Arid4aF8VPQ2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Arid4aF8VPQ2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Arid4aF8VPQ2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Arid4aF8VPQ2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Arid4aF8VPQ2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Arid4aF8VPQ2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Arid4aF8VPQ2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Arid4aF8VPQ2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Arid4aF8VPQ2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Arid4aF8VPQ2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Arid4aF8VPQ2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Arid4aF8VPQ2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Arid4aF8VPQ2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Arid4aF8VPQ2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Arid4aF8VPQ2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Arid4aF8VPQ2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Arid4aF8VPQ2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Arid4aF8VPQ2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Arid4aF8VPQ2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Arid4aF8VPQ2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Arid4aF8VPQ2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Arid4aF8VPQ2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Arid4aF8VPQ2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Arid4aF8VPQ2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Arid4aF8VPQ2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Arid4aF8VPQ2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Arid4aF8VPQ2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Arid4aF8VPQ2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Arid4aF8VPQ2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Arid4aF8VPQ2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Arid4aF8VPQ2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Arid4aF8VPQ2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Arid4aF8VPQ2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Arid4aF8VPQ2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Arid4aF8VPQ2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Arid4aF8VPQ2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Arid4aF8VPQ2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Arid4aF8VPQ2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Arid4aF8VPQ2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Arid4aF8VPQ2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Arid4aF8VPQ2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Arid4aF8VPQ2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Arid4aF8VPQ2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Arid4aF8VPQ2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Arid4aF8VPQ2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Arid4aF8VPQ2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Arid4aF8VPQ2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Arid4aF8VPQ2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Arid4aF8VPQ2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Arid4aF8VPQ2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Arid4aF8VPQ2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Arid4aF8VPQ2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Arid4aF8VPQ2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Arid4aF8VPQ2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Arid4aF8VPQ2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Arid4aF8VPQ2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Arid4aF8VPQ2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Arid4aF8VPQ2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Arid4aF8VPQ2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Arid4aF8VPQ2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Arid4aF8VPQ2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Arid4aF8VPQ2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Arid4aF8VPQ2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Arid4aF8VPQ2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Arid4aF8VPQ2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Arid4aF8VPQ2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Arid4aF8VPQ2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Arid4aF8VPQ2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Arid4aF8VPQ2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Arid4aF8VPQ2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Arid4aF8VPQ2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Arid4aF8VPQ2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Arid4aF8VPQ2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Arid4aF8VPQ2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Arid4aF8VPQ2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Arid4aF8VPQ2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Arid4aF8VPQ2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Arid4aF8VPQ2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Arid4aF8VPQ2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Arid4aF8VPQ2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Arid4aF8VPQ2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Arid4aF8VPQ2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Arid4aF8VPQ2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Arid4aF8VPQ2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Arid4aF8VPQ2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Arid4aF8VPQ2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Arid4aF8VPQ2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Arid4aF8VPQ2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Arid4aF8VPQ2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Arid4aF8VPQ2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Arid4aF8VPQ2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Arid4aF8VPQ2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Arid4aF8VPQ2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms