Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20538F6Z9R1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20538F6Z9R1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20538F6Z9R1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20538F6Z9R1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20538F6Z9R1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20538F6Z9R1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20538F6Z9R1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20538F6Z9R1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20538F6Z9R1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20538F6Z9R1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20538F6Z9R1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20538F6Z9R1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20538F6Z9R1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20538F6Z9R1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20538F6Z9R1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20538F6Z9R1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20538F6Z9R1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20538F6Z9R1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20538F6Z9R1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20538F6Z9R1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20538F6Z9R1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20538F6Z9R1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20538F6Z9R1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20538F6Z9R1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20538F6Z9R1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20538F6Z9R1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20538F6Z9R1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20538F6Z9R1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20538F6Z9R1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20538F6Z9R1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20538F6Z9R1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20538F6Z9R1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20538F6Z9R1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20538F6Z9R1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20538F6Z9R1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20538F6Z9R1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20538F6Z9R1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20538F6Z9R1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm20538F6Z9R1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm20538F6Z9R1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm20538F6Z9R1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20538F6Z9R1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20538F6Z9R1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20538F6Z9R1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20538F6Z9R1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20538F6Z9R1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20538F6Z9R1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20538F6Z9R1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20538F6Z9R1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20538F6Z9R1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20538F6Z9R1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 256 ms