Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5114W4VSN8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5114W4VSN8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms