Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3550W4VSN7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms