Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Top3bQ9Z321 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Top3bQ9Z321 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms