Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms