Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Hdac5Q9Z2V6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hdac5Q9Z2V6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms