Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptgdr2Q9Z2J6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptgdr2Q9Z2J6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms