Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbd4Q9Z2D7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd4Q9Z2D7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms