Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ilf3Q9Z1X4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms