Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lgr5Q9Z1P4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lgr5Q9Z1P4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms