Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne6Q9Z140 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms